Heydər Əliyev Mərkəzində işin təşkili ulu öndər Heydər Əliyevin həyat və fəaliyyətinin, dövlətçilik işinin dərindən öyrənilməsi və Mərkəzə ekskursiyaya gələn insanlara ətraflı məlumatın verilməsi sahəsində işlər görülür. Mərkəzin ümumi sahəsi 722 m2-dir. Mərkəzdə 7 (yeddi) nəfər işçi çalışır. 2 (iki) nəfər ştatdankənardır. Azərbaycan Respublikası Mədəniyyət və Turizm Naziri cənab Əbülfəs Qarayevin 24.01.2012-ci il tarixli 19 saylı Əmrinə əsasən 01.02.2012-ci il tarixdən Heydər Əliyev Muzeyi Mərkəz adlandırılmışdır. Naftalan şəhər Heydər Əliyev Mərkəzi möhtərəm Prezidentimiz cənab İlham Əliyev tərəfindən 2013-cü il sentyabrın 10-da rəsmi açılışı olmuşdur.